Os pesquisadores que integram o OEMESC realizam investigações sobre o Ensino Médio no âmbito dos grupos de pesquisa a que estão vinculados nos Programas de Pós-graduação das Instituições de Ensino Superior – IES parceiras. Nesses grupos são desenvolvidas pesquisas de dissertações e teses, além do desenvolvimento de projetos aprovados em editais internos e/ou externos. Essas investigações compõem o corpus de pesquisas do OEMESC. Além disso, o Observatório desenvolve pesquisas em rede, envolvendo pesquisadores das IES parceiras.